MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 3322

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017381	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017381	TTC	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017381	GGT	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017381	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017381	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017381	TGG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017381	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017381	ACC	2	6	4492	4497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017381	GGT	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017381	TGT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017381	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017381	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017381	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017381	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017381	CAAAAA	2	12	5345	5356	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017381	C	7	7	5357	5363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_017381	A	6	6	5364	5369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017381	A	6	6	5380	5385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017381	A	6	6	5396	5401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017381	A	6	6	5412	5417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017381	A	6	6	5427	5432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017381	A	6	6	7388	7393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017381	AGC	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017381	GA	10	20	7427	7446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017381	T	7	7	7457	7463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017381	T	15	15	7546	7560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017381	T	6	6	7591	7596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017381	GTTT	2	8	7601	7608	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017381	GGT	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017381	TAA	3	9	9430	9438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017381	ATAA	2	8	9823	9830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017381	TTA	2	6	9853	9858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017381	ATTATA	2	12	9917	9928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017381	ATT	2	6	9932	9937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017381	TTA	2	6	9958	9963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017381	CAA	2	6	10000	10005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017381	TATT	2	8	10022	10029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017381	A	6	6	10060	10065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017381	AGG	2	6	12899	12904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017381	T	6	6	13744	13749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017381	GCTTT	2	10	13757	13766	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017381	T	6	6	13764	13769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017381	ACC	2	6	13788	13793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017381	T	7	7	13826	13832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017381	TTAA	2	8	13855	13862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017381	A	6	6	16796	16801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017381	CA	3	6	16843	16848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017381	CTG	2	6	16864	16869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017381	C	6	6	18446	18451	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_017381	AAACAC	2	12	18487	18498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017381	AATC	2	8	22914	22921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017381	T	6	6	22982	22987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017381	GGT	2	6	22990	22995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017381	TGT	2	6	23022	23027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017381	TTA	2	6	23060	23065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017381	GGT	2	6	23110	23115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017381	TTTA	2	8	23179	23186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017381	A	6	6	23193	23198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017381	T	6	6	23211	23216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017381	A	6	6	23236	23241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017381	TTTG	2	8	23243	23250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017381	A	6	6	23255	23260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017381	A	6	6	23263	23268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017381	A	6	6	23342	23347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017381	A	6	6	23358	23363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017381	CTTTA	2	10	25455	25464	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017381	GT	3	6	25503	25508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017381	TAAG	2	8	25512	25519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017381	A	15	15	25595	25609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017381	GTT	2	6	25671	25676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017381	A	6	6	25694	25699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017381	G	7	7	25700	25706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017381	GTT	2	6	25717	25722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017381	TGT	2	6	25738	25743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017381	T	6	6	25752	25757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017381	A	6	6	25760	25765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017381	ATC	2	6	26005	26010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017381	AGCCT	2	10	26029	26038	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017381	A	6	6	27370	27375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017381	A	7	7	27447	27453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017381	TA	3	6	27467	27472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017381	GGTT	2	8	31885	31892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017381	TAA	2	6	40535	40540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017381	A	6	6	40545	40550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017381	AG	3	6	40555	40560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017381	TAA	2	6	42000	42005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017381	ACC	2	6	44331	44336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017381	GCTT	2	8	44337	44344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017381	CTGT	2	8	44451	44458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017381	GAT	2	6	44465	44470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017381	TAG	2	6	44874	44879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017381	ACTTAG	2	12	44880	44891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017381	A	6	6	44932	44937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017381	T	6	6	50489	50494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017381	GATAA	2	10	50582	50591	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017381	T	6	6	50602	50607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017381	TAGC	2	8	50609	50616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017381	TTTA	2	8	59483	59490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017381	T	6	6	59554	59559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017381	GTG	2	6	59579	59584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017381	TAA	3	9	59689	59697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017381	AACGA	2	10	59734	59743	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017381	TTAAA	2	10	59746	59755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017381	ACAAA	2	10	59774	59783	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017381	A	6	6	60022	60027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017381	G	7	7	60028	60034	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017381	TAA	2	6	60035	60040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017381	TGATA	2	10	60088	60097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017381	AGAAAA	2	12	60446	60457	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017381	ACTG	2	8	60479	60486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017381	A	7	7	60487	60493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017381	AAGCC	2	10	60548	60557	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017381	TAC	2	6	62649	62654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017381	CAA	2	6	62669	62674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017381	CTT	2	6	63437	63442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017381	AGG	2	6	64841	64846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017381	TGA	2	6	64897	64902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017381	AG	3	6	64933	64938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017381	ATT	2	6	64959	64964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017381	GGT	2	6	64968	64973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017381	AGA	2	6	64999	65004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017381	A	7	7	66198	66204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017381	A	7	7	66231	66237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017381	A	7	7	69035	69041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017381	A	6	6	69049	69054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017381	G	7	7	69055	69061	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017381	T	6	6	69079	69084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017381	CAAAA	2	10	72425	72434	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017381	ACA	2	6	72440	72445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017381	TTG	2	6	72467	72472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017381	A	6	6	72508	72513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017381	A	7	7	72520	72526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017381	TAA	2	6	72542	72547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017381	ATA	2	6	72548	72553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017381	AG	3	6	72560	72565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017381	T	6	6	75087	75092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017381	TTA	2	6	75167	75172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017381	ATT	3	9	75177	75185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017381	TAT	2	6	75199	75204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017381	A	7	7	75282	75288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017381	TAA	2	6	75325	75330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017381	TGG	2	6	75331	75336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017381	TTTA	2	8	75407	75414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017381	TAGA	2	8	77269	77276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017381	TTACA	2	10	77290	77299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017381	CCA	2	6	78893	78898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_017381	TA	5	10	78951	78960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017381	TAAAA	2	10	78973	78982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017381	ATT	2	6	78985	78990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017381	A	6	6	79007	79012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017381	T	6	6	79018	79023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017381	T	6	6	79120	79125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017381	A	7	7	79144	79150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_017381	CTTT	2	8	134356	134363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
293	NC_017381	CTT	2	6	134382	134387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_017381	T	6	6	134445	134450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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